CARDIOGENET

Il progetto CARDIOGENET studia le reti trascrizionali che regolano lo sviluppo di una regione del cuore comunemente colpita da cardiopatie congenite (CC). L'obiettivo principale della ricerca è di fornire ai ricercatori e alla comunità che si occupa di ricerca scientifica di base, un elenco di geni interconnessi necessari per lo sviluppo normale del cuore.

Per raggiungere questo obiettivo, CARDIOGENET ha riunito 6 gruppi di scienziati europei già impegnati nella ricerca sulle cardiopatie congenite a livello internazionale. Ognuno dei partecipanti porta al consorzio risorse significative e permette di stabilire delle sinergie importanti.

Il punto di partenza per lo studio delle reti genetiche cardiache è il fattore di trascrizione Tbx1, il gene responsabile per lo sviluppo della sindrome da microdelezione cromosomica 22q11.2, una tra le più comuni cause genetiche delle CC.

Il progetto ha tre obiettivi specifici:

1) La definizione dei ruoli e delle interazioni dei fattori di trascrizione T-box nello sviluppo del tratto di efflusso cardiaco. Il progetto intende testare l'ipotesi che sia necessario un preciso equilibrio tra Tbx1, 2 e 3 per regolare l'omeostasi di una determinata popolazione di progenitori cardiaci e le loro interazioni con le cellule non cardiogeniche.

2) La definizione di reti di geni perturbati nello sviluppo di difetti nel tratto di eflusso cardiaco. Un approccio innovativo individuerà gli obiettivi trascrizionali e le proteine che interagiscono con il fattore di trascrizione Tbx1. I geni candidati saranno validati in vitro e in vivo. Inoltre, saranno eseguite estese analisi del trascrittoma attraverso delle biopsie su pazienti affetti da CC, al fine di integrare i dati ottenuti sugli animali con quelle dei pazienti.

3) L'integrazione dell'espressione genica, con i dati di distribuzione delle linee cellulari e i dati fenotipici. Una normale morfologia cardiaca si ottiene infatti attraverso un programma concertato di espressione genica, integrando i segnali molecolari e quelli tessutali.

Con l'ausilio delle tecniche di ricostruzione di pattern di espressione genica 3D e delle informazioni fenotipiche, i diversi tipi di dati verranno integrati, con lo scopo finale di sviluppare modelli di patogenesi di CC.

La presenza di diversi team di ricerca europei favorirà la condivisione di tecnologie all'avanguardia e consentirà di ottenere risultati omogenei e comparabili tra gruppi di dati diversi.